推进学会改革与发展是本届科协三件大事之一。这项工作在2004年开局起步，并已取得初步成效。2005年一方面是进一步扩大学会试点范围，另一方面是通过深入研讨和梳理，结合新形势、新要求提出下一步推进学会改革与发展工作的具体思路和任务。2005年10月，在向市委、市科教党委分别作《推进学会改革与发展，提升为科教兴市主战略服务的能力》的专题汇报，较明确地提出市科协推进学会改革与发展工作下一阶段的总体目标、工作思路和主要措施之后，这项工作的开展基本实现了从2004年的开局起步到2005的深化认识、明确目标、聚焦重点的转变，从而既体现了工作的连续性，又体现了工作的创新性。2005年的具体工作如下：
　　1、编辑出版了记录2004年市科协推进学会改革与发展试点工作的《新世纪初上海科技社团改革与发展实录》一书，并已发送至中国科协、全国各省市科协及市科协所属学会、区县科协、市有关部门等交流。
　　2、召开了上海市科协学术、学会工作交流会。会上向学会及区县科协介绍了2005年市科协推进学会改革与发展方案要点，并对2005年工作进行动员和部署，生物物理、化学化工、包装技术三个学会作了试点工作经验交流。
　　3、在2004年5个试点学会基础上，2005年选择了15个学会作为拓展试点学会，并召开了推进学会改革与发展工作第二阶段拓展试点学会座谈会，听取学会还各自改革与发展的工作计划和对推进学会改革与发展工作的意见和建议。
　　4、在前后两位市科协分管领导的带领下，分批走访了15家拓展试点学会了解情况，听取建议，并与学会共同研究探讨推进学会改革与发展的措施和方法。
　　5、按照党组提出的深化对推进学会改革与发展工作的认识，提出下一步工作具体工作思路和任务的要求，通过进一步的研讨和梳理，形成了《进一步推进学会改革与发展的工作思路和任务》，为党组向市委、市政府、市科教党委汇报相关工作提供了基本材料。
　　6、召开工作通气会，向2004年确定的造船、物理、生物物理、化学化工、包装等5个试点学会通报了下一步推进学会改革与发展的工作思路和任务，并听取了他们的工作进展情况和下一步工作打算。
　　7、根据下一步工作思路和任务，全面展开了“对学会分类指导及分类评估研究”、“市科协学会管理办法研究”、“学会融入科教兴市主战略的途径与支撑条件研究”等三项课题调研。调研成果将为出台相关文件提供依据。目前三项课题都已形成初步成果。
　　8、市工程师学会进一步完善学会的运行模式，加强建章立制工作，学会建立了9项规章制度和标准化专委员会的会员申请资格标准和吸收标准化工程师会员的程序，开展了质量专业委员会会员申请资格标准试点工作。市标准化、化学化工、机械工程、包装技术和激光等5个学会已着手进行专业工程师资格认证的试点工作。
　　9、为贯彻国家中组部、民政部和市委的有关文件精神，市造船工程学会、市纺织工程学会、市生物物理学会等3个学会率先在理事会层面建立“党的工作小组”，进一步探索学会党建工作。
　　10、为探索市级学会参与“市抓实力、区县抓活力、企业抓动力”建设，加强市区联动，同时推进学会改革与发展，召开了“加强市区联动，推进市级学会参与区县抓活力”研讨会。邀请了浦东、徐汇、长宁、虹口、杨浦等部分区科协的负责人参加。
　　11、承办了“华东、东北地区科协学会工作研讨会”。来自“两东”地区九省一市的科协领导和负责学会工作的同志出席了研讨会。上海市科协在研讨会上作了“推进学会改革与发展，提升为科教兴市主战略服务的能力”的专题发言。